mirna21银屑病 银屑病指南2018解读

mirna靶基因预测

首先，基于序列匹配的方法通过比较miRNA序列与靶基因3非翻译区（3 UTR）序列，寻找互补配对的miRNA靶位点。常用工具如TargetScan、miRanda、PicTar等。其次，基于保守性的方法利用跨物种基因组序列比对，预测miRNA靶位点上的保守序列区域，识别可能的靶基因。PhyloP、PhastCons等工具适合进行此类保守性分析。

使用miRWalk0数据库，研究者可以通过输入基因名、EntrezID、EnsemblID或RefseqID来预测miRNA-mRNA相互作用关系。支持预测靶位点在5UTR、CDS、3UTR，通常在3UTR区域，因此建议下载3UTR数据。下载后，用户可以查看数据库本身算法的预测结果以及来自其他12个miRNA-mRNA相互作用预测数据库的结果。

使用miRWalk0数据库时，研究者可通过输入不同基因ID（如基因symbol、EntrezID、EnsemblID或RefseqID）来预测miRNA-mRNA相互作用。根据基因类型，用户可选择查询5UTR、CDS、3UTR区域，通常miRNA靶位点主要在3UTR，因此直接下载3UTR数据即可。点击下载按钮即可获取相关数据。